第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值
在进行基因表达的相对定量时,内参基因的选择至关重要。为确保结果的有效性,应遵循以下原则:
- 优先选择表达稳定且丰盈的基因作为内参基因。
- 避免盲目采用常用内参基因,务必根据实验需求进行选择。
- 常用的内参基因包括GAPDH、Actin及Tublin。
在添加内参基因后,进行结果计算将有助于更准确地评估目标基因的表达情况。
二、绝对定量
绝对定量方法通过标准品来测定样品中基因表达的绝对值(拷贝数)。以下是标准品的几种选择:
- A:具有明确拷贝数浓度的样品
- B:克隆质粒
- C:PCR产物
- D:cDNA(注意:用于扩增效率测定,但不适于绝对定量)
拷贝数的计算依赖于平均分子量(MW)公式:
- dsDNA = (碱基数) x (660道尔顿/碱基)
- ssDNA = (碱基数) x (330道尔顿/碱基)
- ssRNA = (碱基数) x (340道尔顿/碱基)
拷贝数计算的公式为:
(6.022 x 10²³ 拷贝数/摩尔) x (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml
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